primer premier 6.0是生物科學領域的常用軟件之一，能夠以多種方式幫助用戶進行基因分析，其中包括引物設計、同源性分析等等，同時操作起來也比較方便。

軟件介紹

加拿大的Premier公司開發的專業用于PCR或測序引物以及雜交探針的設計和評估程序。其包含序列編輯窗口、引物設計窗口、酶切分析窗口和紋基分析窗口四個界面窗口，其分別為用戶提供引物設計、限制性內切酶位點分析和DNA基元查找和同源性分析功能。primer premier還可針對面板DNA的來源以相應的遺傳密碼規則轉換DNA和氨基酸序列，它給出了八種生物亞結構的不同遺傳密碼規則供用戶選擇，例如纖毛蟲大核、無脊椎動物線粒體和支原體等。

激活說明

1、安裝完成之后，將crack文件夾中的“patcher.jar”復制到程序安裝目錄中：

Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600

2、按“windows+R”，輸入cmd，打開dos系統

3、輸入d: 回車

4、然后輸入（鼠標右鍵粘貼，這里根據安裝的盤符以及安裝路徑進行改變，前面的“cd”不變）

cd D:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600 回車

5、再輸入“java -jar patcher.jar”回車，顯示“done”則表示成功

特色說明

1、具有優秀的引物自動搜索功能，同時可進行部分指標的分析，而且容易使用，已被引物設計行業人士認為是一款相當不錯的軟件。

2、主要功能分四種，即引物設計、限制性內切酶位點分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三種為其主要功能。此外，該軟件還有一些特殊功能，其中最重要的是設計簡并引物，另外還有序列"朗讀"、DNA 與蛋白序列的互換、語音提示鍵盤輸入等等。

3、可以針對模板DNA 的來源以相應的遺傳密碼規則轉換DNA 和氨基酸序列。軟件共給出八種生物亞結構的不同遺傳密碼規則供用戶選擇，有纖毛蟲大核（Ciliate Macronuclear）、無脊椎動物線粒體（Invertebrate Mitochondrion）、支原體（Mycoplasma）、植物線粒體（Plant Mitochondrion）、原生動物線粒體（Protozoan Mitochondrion）、一般標準（Standard）、脊椎動物線粒體（Vertebrate Mito-chondrion）和酵母線粒體（Yeast Mitochondrion）。

如何使用

1、開始引物設計，這就需要知道基因序列。一般用NCBI查找，比如要設計rat的CK18 mRNA檢測引物。首先選擇Nucleotide，然后在搜索欄輸入rat CK18，結果如下。

2、我們要找mRNA，所以選第一個，點進去后拉到最后的ORIGIN就能找到基因序列，把這段序列復制到軟件中進行引物設計。

3、點這個搜索，出現下面對話框，這里可以選擇引物在序列哪些地方設計引物，一般不用更改，也就是引物可以設計在整個序列，當然也可以事先查一下序列有幾個區，一般引物會跨兩個區。

4、設置退火溫度、引物長度、產物長度等，點旁邊的“Primer Parameters”。主要更改的也就是產物長度，100到300bp為宜，產物太大，會影響擴增效率。